Berlatar di kota Akademi, merupakan tempat di mana orang-orang yang memiliki kekuatan (esper) tinggal. Para esper dibagi menjadi beberapa tingkat, yang terendah level 0 hingga yang terkuat level 5. Bercerita tentang seorang remaja bernama Accelerator. Ia merupakan salah satu esper level 5, bahkan ia merupakan esper terkuat dari tujuh esper berlevel 5 yang ada di kota akademi.